实验室自组建以来，针对自身的具体情况，切实加强实验室规章制度的建设，讨论并印制了《实验室管理规章制度汇编》，包括：《实验室工作条例》、《学术委员会工作条例》、《机房管理制度》、《仪器设备管理条例》、《数据管理与共享管理条例》、《开放基金管理条例》、《分析实验室安全管理办法》、《分析实验室规则》、《研究生分析实验室工作规定》、《实验室固定工作人员管理办法》、《实验室客座研究人员管理办法》、《实验室研究生管理办法》、《实验室绩效考核办法》、《学术交流活动管理办法》、《国际学术交流工作管理方法》15项规章制度。